Laboratorium Mikrobiologi dan Lingkungan telah ditunjuk sebagai laboratorium pengujian mutu pupuk organik oleh Kementan RI. LP-PPBBI merupakan laboratorium pengujian pertama di Indonesia yang terakreditasi untuk parameter pengujian mikroba dalam pupuk hayati.

Jenis Jasa Pengujian  meliputi: Populasi Mikroba dalam Pupuk Hayati, Pupuk Organik dan Biodekomposer Bakteri/Fungi pelarut fosfat Bakteri penambat nitrogen simbiotik  (Rhizobium) dan non-simbiotik (Azotobacter,  Azospirilium) Total bakteri/Fungi Trichoderma sp, Aspergillus, dan fungi pendekomposer lainnya PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacter) Kontaminasi Bakteri (E.coli dan Salmonella sp.) Uji Patogenitas

Populasi bakteri dan fungi dalam udara, di ruang kerja, rumah sakit serta pabrik  makanan dan farmasi

Pengujian mutu limbah padat dan cair : C/N ratio, BOD, COD, DO, TS, TSS, VSS, pH,  kadar klorin, dll